Diagnosi, genotipizzazione, patogenicità ed epidemiologia di xylella fastidiosa a supporto di strategie di contenimento della diffusione del batterio
Obiettivo generale della ricerca
Acquisire una serie di dati sperimentali su Xylella fastidiosa (Xf) rinvenuto nel Salento, chiamato “strain CoDiRO”, mediante intense attività di ricerca volte a definire le caratteristiche genetiche, l’eziologia ed epidemiologia; elementi fondamentali per pianificare efficaci strategie di controllo per ridurre l’impatto e la diffusione di Xf e tutelare il comparto agricolo e vivaistico dei paesi del Mediterraneo
Principali risultati prodotti
Sequence type di ceppo CoDiRO – ST53 (Database)
Protocolli nuovi o implementati per la diagnosi specifica della strain CoDiRO nelle piante suscettibili all’infezione (Protocollo)
Dati sulla diffusione in pieno campo della strain CoDiRo (Database)
Lista di piante ospiti di Xf nell’area focolaio (Rapporto)
Lista di potenziali insetti vettori (Rapporto)
Dati sulla trasmissione di Xf da parte di potenziali vettori autoctoni (Database)
Principale know-how prodotto
Caratterizzazione filogenetica del ceppo CoDiRO e del genoma completo del ceppo CoDiRO da olivo
Sviluppo di nuove conoscenze scientifiche relative al ruolo patogenico di X. fastidiosa e alle varietà di olivo suscettibili/tolleranti
Implementazione di protocolli per la diagnosi in campo e “intervalidazione” delle tecniche di diagnosi
Sfida sociale: Prevenzione, contrasto e controllo della Xylella
Il ritrovamento di X. fastidiosa (Xf) in Puglia, dapprima in forma di piccoli focolai e successivamente in forma epidemica in gran parte della penisola Salentina, rappresenta una seria minaccia per l'olivicoltura, e non solo, di tutto il bacino del Mediterraneo. Le attività progettuali hanno permesso di sviluppare e implementare le tecniche diagnostiche per Xf e acquisire conoscenze sulle caratteristiche genetiche dell'isolato salentino, sulla patogenicità, sull'ampia diffusione territoriale dell'epidemia, sulla corposa gamma d'ospiti che comprende 32 specie per lo più arbustive, oltre all'olivo, e sulle modalità di trasmissione mediante insetti vettori quali la sputacchina (Philaenus spumarius). Tali informazioni scientifiche, in continua evoluzione, sono state di supporto per la implementazione delle misure legislative e delle misure tecniche di controllo dell'epidemia adottate fino ad ora
Collaborazioni internazionali rilevanti attivate
- Università della California - Dep. Environmental Science (Progetti congiunti)
Analisi filogenetica su 27 genomi di isolati di Xf, incluso gli isolati ST53
- CSIC - Instituto De Agricultura Sostenibile (Progetti congiunti)
Sviluppo di un saggio diagnostico rapido per la differenziazione degli isolati appartenenti alle diverse subspecie di X. fastidiosa
- ANSES - French agency for food, environmental and occupational health and safety (Progetti congiunti)
Validazione di protocolli mediante interlaboratory validation, organizzazione training
- AGDIA srl (Accordi)
Validazione di protocolli mediante interlaboratory validation, organizzazione training
Collaborazioni nazionali rilevanti attivate
- CNR - IPSP (Progetti congiunti)
Ottenimento del genoma completo di Xf da olivo e studio della patogenicità del ceppo CoDiRO su olivo
Collaborazioni regionali rilevanti attivate
- Agritest srl (Progetti congiunti)
Implementazione dei protocolli di diagnosi rapidi e applicabili in campo
- CRSFA - Centro di Ricerca, Sperimentazione e Formazione in Agricoltura Basile Caramia (Progetti congiunti)
Validazione di protocolli mediante interlaboratory validation, organizzazione training
- Loconsole G., Saponari M., Boscia D., D'Attoma G., Morelli M., Martelli G.P., Almeida R.P.P. (2016) Intercepted isolates of Xylella fastidiosa in Europe reveal novel genetic diversity. European Journal of Plant Pathology
- Giampetruzzi A., Morelli M., Saponari M., Loconsole G., Chiumenti M., Boscia D., Savino V.N., Martelli G.P., Saldarelli P. (2016) Transcriptome profiling of two olive cultivars in response to infection by the CoDiRO strain of Xylella fastidiosa subsp. Pauca. BMC Genomics
- Cornara D., Saponari M., Zeilinger A.R., De Stradis A., Boscia D., Loconsole G., Bosco D., Martelli G.P., Almeida R.P.P., Porcelli F. (2017) Spittlebugs as vectors of Xylella fastidiosa in olive orchards in Italy. Journal of Pest Science
- Saponari M., Boscia D., Altamura G., D'Attoma G., Cavalieri V., Zicca S., Morelli M., Tavano D., Loconsole G., Susca L., Potere O., Savino V., Martelli G.P., Palmisano F., Dongiovanni C., Saponari A., Fumarola G., Di Carolo M. (2016) Pilot project on Xylella fastidiosa to reduce risk assessment uncertainties. EFSA Supporting publication
- Giampetruzzi A., Saponari M., Loconsole G., Boscia D., Savino V.N., Almeida R.P.P., Zicca S., Landa B.B., Chacón-Diaz C., Saldarelli P. (2017) Genome-Wide Analysis Provides Evidence on the Genetic Relatedness of the Emergent Xylella fastidiosa Genotype in Italy to Isolates from Central America. Phytopathology
- Giampetruzzi A., Saponari M., Almeida R.P.P., Essakhi S., Boscia D., Loconsole G., Saldarelli P. (2017) Complete Genome Sequence of the Olive-Infecting Strain Xylella fastidiosa subsp. pauca De Donno. Genome Announc. 2017
- Boscia D., Altamura G., Ciniero A., Di Carolo M., Dongiovanni C., Fumarola G., Giampetruzzi A., Greco P., La Notte P., Loconsole G., Manni F., Melcarne G., Montilon V., Morelli M., Murrone N., Palmisano F., Pollastro P., Potere O., Roseti V., Saldarelli P., Saponari A., Saponari M., Savino V., Silletti M.R., Specchia F., Susca L., Tauro D., Tavano D., Venerito P., Zicca S., Martell G.P. (2017) Resistenza a Xylella fastidiosa in diverse cultivar di olivo. L'informatore agrario
- Saponari M., Boscia D., Altamura G., Loconsole G., Zicca S., D'Attoma G., Morelli M., Palmisano F., Saponari A., Tavano D., Savino V.N., Dongiovanni C., Martelli G.P. (2017) Isolation and pathogenicity of Xylella fastidiosa associated to the olive quick decline syndrome in southern Italy. Scientific Reports
- Saponari M., Giampetruzzi A., Loconsole G., Boscia D., Saldarelli P. (2018) Xylella fastidiosa in Olive in Apulia: Where We Stand. Phytopathology
Loconsole Giuliana
AGR/12 Patologia vegetale
Dipartimento di Scienze del suolo, della pianta e degli alimenti
Università degli Studi di Bari "Aldo Moro"